Prof. Wolfgang Heiniger wurde in Basel geboren. Er studierte Schlagzeug und Elektroakustische Musik an der Musikhochschule Basel. Einem Aufenthalt als Gaststudent am CCRMA Stanford in den USA folgte ein Kompositionsstudium in Basel bei Thomas Kessler. Wolfgang Heiniger trat als Schlagzeuger mit verschiedenen Orchestern und Ensembles u.a. bei den Wiener Festwochen und dem Warschauer Herbst auf. Als Performer, Interpret und Klangregisseur ist er auf Konzerten und Festivals in Europa, Südamerika und Asien zu erleben.

Er ist Mitgründer und Mitglied von THE BEAM (Basel Electric Art Messengers) und des "European Powerbook Orchestra". Seine Kompositionen umfassen Werke für Live-Elektronik und szenische Musik sowie Instrumentalmusik und Musik für Tanztheater, Bühne und Film.

Wichtiger Bestandteil vieler seiner Kompositionen sind interaktive und szenische Konzepte, bei deren Realisation der Computer, Sensorsysteme und mathematische Modelle eine wesentliche Rolle spielen.

Im organisatorisch-institutionellen Bereich engagiert sich Wolfgang Heiniger seit 1989 als Vorstandsmitglied und Programmrat bei verschiedenen Verbänden und Festivals. So gründete er u.a. mit Thomas Kessler das "Echt!Zeit"-Festival und ist im Programmrat des Festival Rümlingen und des "Gare Du Nord" Basel tätig. Von 1995 bis 2003 leitete Wolfgang Heiniger den von ihm aufgebauten Studiengang Audio-Design an der Hochschule für Musik Basel und war von 1999 bis 2003 Co-Leiter des Elektronischen Studios ESB.
Zum Sommersemester 2003 wurde Wolfgang Heiniger als Professor für Intermediale Komposition an die Hochschule für Musik "Hanns Eisler" Berlin berufen.